-Basecamp Research推出全球首個(gè)可編程基因插入AI模型
倫敦和馬薩諸塞州劍橋2026年1月12日 /美通社/ -- 利用演化設(shè)計(jì)新藥的前沿AI實(shí)驗(yàn)室Basecamp Research今日宣布,推出首批可實(shí)現(xiàn)可編程基因插入的AI模型,為替換有缺陷的基因以及出于治療目的對(duì)細(xì)胞進(jìn)行重新編程提供了新的途徑。 這些模型是與NVIDIA合作訓(xùn)練而成,為新一代癌癥和遺傳性疾病治療方法的開(kāi)發(fā)提供動(dòng)力。 此外,經(jīng)過(guò)多年密切技術(shù)合作后,Basecamp Research在C輪融資前獲得NVentures(NVIDIA的風(fēng)險(xiǎn)投資部門(mén))的一筆投資,這將有助于該公司加速研發(fā)工作。
Basecamp Research首席科學(xué)官John Finn表示:"我們相信,癌癥和遺傳性疾病患者可享有的治療手段將迎來(lái)大幅擴(kuò)展。 通過(guò)使用AI設(shè)計(jì)治療酶,我們希望針對(duì)數(shù)千種無(wú)法治愈疾病加快開(kāi)發(fā)治愈方法,進(jìn)而有望使數(shù)以百萬(wàn)計(jì)的人獲得新生。"
可編程基因插入
可編程基因插入是指將具有治療作用的大DNA序列放置在人類(lèi)基因組中的精確位置,這是遺傳醫(yī)學(xué)幾十年來(lái)追求的一項(xiàng)核心目標(biāo)。 基于CRISPR的現(xiàn)有方法僅可進(jìn)行小片段編輯,而且為此必須破壞DNA,因而其使用位置和方式受到了限制。 Basecamp Research率先證明,AI可設(shè)計(jì)出能在人類(lèi)基因組的特定位點(diǎn)執(zhí)行大基因插入的酶,為可編程療法開(kāi)辟了一條尋求已久的道路。
Basecamp Research的AI可編程基因插入(aiPGI?)平臺(tái)由EDEN驅(qū)動(dòng),后者是與NVIDIA合作開(kāi)發(fā)的全新演化AI模型系列,基于該公司專(zhuān)有的同類(lèi)最大基因組學(xué)數(shù)據(jù)集BaseData?進(jìn)行訓(xùn)練。 這些模型學(xué)習(xí)DNA語(yǔ)言和演化模式,使算法能針對(duì)癌癥和遺傳性疾病設(shè)計(jì)新的可編程療法。
根據(jù)今日發(fā)表的由NVIDIA、Microsoft和多位領(lǐng)先學(xué)者共同撰寫(xiě)的一篇論文的實(shí)驗(yàn)室結(jié)果[link],EDEN模型為人類(lèi)基因組中100%的經(jīng)檢測(cè)疾病相關(guān)靶位點(diǎn)設(shè)計(jì)了多種活性插入蛋白,僅需要基因組靶位點(diǎn)作為提示,標(biāo)志著AI模型能力取得重大進(jìn)步。
Basecamp Research已演示過(guò)在人類(lèi)基因組的超過(guò)10,000個(gè)疾病相關(guān)位點(diǎn)進(jìn)行插入,包括在新的安全位點(diǎn)將抗癌DNA以治療相關(guān)的方式整合到原始人類(lèi)T細(xì)胞中。 由此產(chǎn)生的CAR-T細(xì)胞表現(xiàn)出對(duì)癌細(xì)胞的強(qiáng)大殺傷力,實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)顯示腫瘤細(xì)胞清除率超過(guò)90%。
對(duì)抗"超級(jí)細(xì)菌"的AI設(shè)計(jì)分子
在另一項(xiàng)針對(duì)全球耐藥性危機(jī)的關(guān)鍵前沿治療設(shè)計(jì)任務(wù)中,同一模型展現(xiàn)了多功能性,設(shè)計(jì)出針對(duì)性的新型抗菌肽(AMP)庫(kù)——有望殺死有害細(xì)菌的小蛋白,97%的候選產(chǎn)品在實(shí)驗(yàn)室檢驗(yàn)中證實(shí)具有活性。 在與César de la Fuente教授為首的賓夕法尼亞大學(xué)科學(xué)家的合作中,表現(xiàn)最佳的AMP對(duì)具有關(guān)鍵優(yōu)先級(jí)、多藥耐藥性病原體表現(xiàn)出高度效力,為對(duì)抗危險(xiǎn)的"超級(jí)細(xì)菌"提供了強(qiáng)有力的新工具。
由獨(dú)特?cái)?shù)據(jù)和前沿AI模型推動(dòng)實(shí)現(xiàn)的突破
為aiPGI?提供驅(qū)動(dòng)力的EDEN模型,采用基于來(lái)自逾100萬(wàn)個(gè)新發(fā)現(xiàn)物種、超過(guò)10萬(wàn)億個(gè)演化DNA token(基本處理單位)進(jìn)行訓(xùn)練。 這些數(shù)據(jù)是在五年內(nèi)從五大洲28個(gè)國(guó)家或地區(qū)的150多個(gè)地點(diǎn)收集,是2025年6月發(fā)布的該公司首創(chuàng)的新型數(shù)據(jù)收集策略的一部分。
最大的EDEN模型基于1,008個(gè)NVIDIA Hopper GPU集群的1.95 x1024FLOPS算力進(jìn)行訓(xùn)練,并使用來(lái)自NVIDIA BioNeMo的多個(gè)庫(kù)進(jìn)行加速,使其在規(guī)模上可與GPT-4類(lèi)模型相媲美,并成為有報(bào)道以來(lái)算力密度最高的生物學(xué)模型之一。
開(kāi)發(fā)中的治療資產(chǎn)
這些能力為Basecamp Research新興的細(xì)胞和基因療法儲(chǔ)備產(chǎn)品提供支撐,為開(kāi)發(fā)比現(xiàn)有產(chǎn)品更加精確、可預(yù)測(cè)及個(gè)性化的療法打開(kāi)了大門(mén)。 該公司的目標(biāo)是通過(guò)對(duì)BaseData?、EDEN模型和aiPGI?的不斷改進(jìn),開(kāi)發(fā)出對(duì)多種癌癥和遺傳性疾病適應(yīng)癥具有潛在治愈效果的療法。
關(guān)于Basecamp Research
Basecamp Research致力于通過(guò)探索"生物學(xué)的已知邊界之外"(Beyond Known Biology?),解決生命科學(xué)領(lǐng)域的主要挑戰(zhàn)。 該公司使用BaseData構(gòu)建前沿AI模型。BaseData是全球最大、來(lái)源合乎道德及具有全球代表性的生物數(shù)據(jù)集。 Basecamp Research通過(guò)與28個(gè)國(guó)家/地區(qū)的超過(guò)152個(gè)組織合作,收集和整理自有的生物數(shù)據(jù),使其開(kāi)發(fā)的AI得以利用經(jīng)公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)來(lái)源訓(xùn)練的模型所不具備的遺傳學(xué)多樣性。 借此,Basecamp Research可設(shè)計(jì)能加快治療研發(fā)的新型蛋白質(zhì)序列和生物系統(tǒng)。
Basecamp Research與全球生物制藥公司和學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)合作,其工作屢獲殊榮,包括Fast Company生物技術(shù)領(lǐng)域十大最具創(chuàng)新力公司和FT(《金融時(shí)報(bào)》)支持的Sifted AI100歐洲領(lǐng)先AI初創(chuàng)公司精選榜單等榮譽(yù)。 如需了解更多信息,請(qǐng)?jiān)L問(wèn)basecamp-research.com。
BaseData?、Beyond Known Biology?、EDEN-GLM?和aiPGI?是Basecamp Research的品牌名稱(chēng)和技術(shù)。